Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms