Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms