Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC24A5Q71RS6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms