Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms