Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms