Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms