Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CDK5R1Q15078 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CDK5R1Q15078 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CDK5R1Q15078 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CDK5R1Q15078 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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CDK5R1Q15078 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CDK5R1Q15078 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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