Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms