Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NR1D2Q14995 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NR1D2Q14995 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NR1D2Q14995 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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