Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC3Q14574 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms