Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms