Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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