Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms