Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms