Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1386.7 ms