Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF1P22415 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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