Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PVALBP20472 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PVALBP20472 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PVALBP20472 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms