Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDCP19113 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDCP19113 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDCP19113 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDCP19113 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms