Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F9P00740 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F9P00740 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F9P00740 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms