Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC9O60706 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms