Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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