Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF7Q9UBF6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF7Q9UBF6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF7Q9UBF6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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