Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms