Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms