Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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