Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA1Q8N8W4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms