Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUPD1Q68J44 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms