Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAMD13Q5VXD3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SAMD13Q5VXD3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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