Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms