Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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