Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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