Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOBEC1P41238 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms