Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms