Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DMDP11532 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DMDP11532 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DMDP11532 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DMDP11532 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms