Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHGAP10645 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHGAP10645 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms