Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOP08100 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms