Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms