Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX4O95219 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX4O95219 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX4O95219 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX4O95219 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX4O95219 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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