Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms