Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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