Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z7

HCFC2, Host cell factor 2, humanhuman

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC2Q9Y5Z7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCFC2Q9Y5Z7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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