Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CPNE7Q9UBL6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CPNE7Q9UBL6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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