Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms