Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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