Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms