Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms