Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms