Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms