Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms