Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCB5Q2M3G0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms